Z dniem 1 stycznia 2016 r. w życie weszły przepisy zmieniające właściwość organów podatkowych. Choć duże zmiany dotyczą podatku od towarów i usług, część z nich dotyczy również podatek CIT. Zmieniona Ordynacja podatkowa wprowadziła m. in. dwie zasadnicze zasady z zakresu rozwiązań dotyczących właściwości miejscowej organów podatkowych.

Po pierwsze: w zakresie praw i obowiązków podatnika, płatnika i inkasenta przejętego przez następcę prawnego właściwym miejscowo organem jest organ następcy. Wyjątkiem od tej zasady jest właściwość organu w sprawach następstwa prawnego spadkobierców i zapisobierców, na który wyznaczono urząd właściwy dla ostatniego miejsca zamieszkania spadkodawcy.

Po drugie, Ordynacja podatkowa daje możliwość wyznaczenia jednego urzędu skarbowego właściwego dla kilku podatników, w przypadku podejrzenia przestępstwa lub konieczności zabezpieczenia dowodów