Poza „zwykłymi” urzędami skarbowymi, w polskiej administracji podatkowej funkcjonuję tzw. urzędy wyspecjalizowane, czyli urzędy, które zostały powołane do obsługi określonej grupy podatników. Wśród nich znajdują się:

• podatkowe grupy kapitałowe
• banki, zakłady ubezpieczeń
• jednostki działające na podstawie przepisów o obrocie instrumentami finansowymi oraz funduszach inwestycyjnych, a także przepisów o organizacji i funkcjonowaniu funduszy emerytalnych
• oddziały lub przedstawicielstwa przedsiębiorstw zagranicznych.

Powyższe podmioty bezwarunkowo są obsługiwane przez urzędy wyspecjalizowane, natomiast poza kryterium podmiotowym, ustawodawca przewidział również kryterium podmiotowe, które obejmuje osoby prawne lub jednostki organizacyjne nieposiadające osobowości prawnej, które:

• w ostatnim roku podatkowym osiągnęły przychód netto, w rozumieniu przepisów o rachunkowości, ze sprzedaży towarów, wyrobów i usług o równowartości co najmniej 5 mln euro według kursu średniego ogłaszanego przez Narodowy Bank Polski na koniec roku podatkowego albo
• jako rezydenci w rozumieniu przepisów prawa dewizowego, biorą udział bezpośrednio lub pośrednio w zarządzaniu przedsiębiorstwami położonymi za granicą lub w ich kontroli, albo posiadają udział w kapitale takich przedsiębiorstw albo
• są zarządzane bezpośrednio lub pośrednio przez nierezydenta w rozumieniu przepisów prawa dewizowego lub nierezydent dysponuje co najmniej 5% głosów na zgromadzeniu wspólników albo na walnym zgromadzeniu, albo
• jako rezydenci w rozumieniu przepisów prawa dewizowego jednocześnie bezpośrednio lub pośrednio biorą udział w zarządzaniu podmiotem krajowym i podmiotem zagranicznym w rozumieniu innych ustaw lub w jego kontroli albo posiadają jednocześnie udział w kapitale takich podmiotów.